要将论文查重系统与学术写作软件结合使用，首先需要明确两者的功能和作用。论文查重系统主要用于检测论文的原创性和重复率，而学术写作软件则是辅助学术写作的工具。在使用过程中，可以先通过学术写作软件进行论文的撰写和排版，然后再利用论文查重系统对论文进行查重和修改。这样可以帮助作者及时发现和修改论文中存在的问题，提高论文质量和原创性。另外，还可以利用学术写作软件中的参考文献管理功能，帮助规范引用格式，减少抄袭风险。

另外，还可以通过学术写作软件导出的文档格式进行论文查重，以确保格式和排版的准确性。同时，在使用学术写作软件时，也可以结合论文查重系统提供的反面例句和相似度分析，帮助优化论文内容和结构。总的来说，论文查重系统与学术写作软件的结合使用，可以帮助作者更高效地撰写论文，提升学术水平和质量。